MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-7

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017412	TA	3	6	22	27	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017412	T	6	6	46	51	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017412	A	6	6	66	71	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017412	CTC	2	6	658	663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017412	TATAA	2	10	1254	1263	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017412	TACAC	2	10	1266	1275	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017412	ACAAA	2	10	1279	1288	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017412	AAG	2	6	1336	1341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017412	A	9	9	4636	4644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017412	A	8	8	4660	4667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017412	CATC	2	8	4674	4681	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017412	ATT	2	6	4727	4732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017412	CAA	2	6	4987	4992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017412	TAA	2	6	5666	5671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017412	A	6	6	5670	5675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017412	AAATA	2	10	5717	5726	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017412	T	6	6	7837	7842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017412	AAT	2	6	7848	7853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017412	ATA	2	6	7923	7928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017412	TA	3	6	7954	7959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017412	A	6	6	7962	7967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017412	T	6	6	7993	7998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017412	GCTCTC	2	12	11148	11159	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017412	GTTC	2	8	11183	11190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017412	AAAC	2	8	11198	11205	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017412	GCC	2	6	11226	11231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017412	T	9	9	11392	11400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017412	CCT	2	6	14708	14713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_017412	T	7	7	14715	14721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017412	CCT	2	6	15798	15803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017412	AAATT	2	10	15806	15815	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017412	T	7	7	24482	24488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017412	A	7	7	24497	24503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017412	TACT	2	8	24512	24519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017412	A	6	6	24524	24529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017412	TAAA	2	8	24530	24537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017412	CTAG	2	8	24545	24552	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017412	CAA	2	6	24579	24584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017412	ATT	2	6	24600	24605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017412	A	6	6	24644	24649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017412	T	6	6	24657	24662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017412	T	7	7	24666	24672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017412	A	6	6	24678	24683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017412	AT	3	6	24693	24698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017412	T	7	7	24723	24729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017412	A	6	6	24743	24748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017412	AGC	2	6	24785	24790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017412	AGG	2	6	26330	26335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017412	ATA	2	6	26766	26771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017412	AGG	2	6	26772	26777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017412	GTT	2	6	26834	26839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017412	CAG	2	6	26852	26857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017412	T	7	7	26878	26884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017412	ATT	2	6	26894	26899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017412	T	6	6	28309	28314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017412	T	6	6	29084	29089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017412	TA	3	6	29866	29871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017412	CTT	2	6	29872	29877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017412	AAG	2	6	29892	29897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017412	T	6	6	29982	29987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.